Identification bactérienne par spectrométrie de masse de type MALDI-TOF : évaluation au CHU de Lille - 09/02/10
, O. Gaillot, R.-J. Courcol
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Résumé |
Objet de l’étude |
Le but de notre travail a été d’évaluer l’intérêt de la spectrométrie de masse de type MALDI-TOF pour l’identification d’espèces bactériennes d’importance médicale, en comparant ses performances à celles du système automatisé d’identification Vitek 2 (bioMérieux) utilisé en routine dans le laboratoire de bactériologie du CHU de Lille.
Méthodes |
Trois cent soixante-deux souches représentant 178 espèces issues de la collection du laboratoire ont été étudiées à la fois en spectrométrie de masse (Microflex, Bruker Daltonics) et par Vitek 2. Lorsqu’il existait une discordance entre les identifications MALDI-TOF et Vitek 2, l’identification génotypique (rrS, sodA, rpoB) était prise en compte et considérée comme référence.
Résultats |
Parmi les 362 isolats analysés, 264 (73 %) ont été identifiés de façon concordante par les systèmes Vitek 2 et Microflex. Parmi les 98 isolats restant, 44 (44,9 %) ont été correctement identifiés à l’espèce par spectrométrie de masse, mais pas par Vitek 2. À l’inverse, 33 isolats (33,7 %) ont été correctement identifiés par Vitek 2, mais pas par Microflex. Enfin, pour 21 isolats (21,4 %), ni l’identification Microflex ni celle de Vitek 2 ne correspondaient à l’identification génétique.
Conclusion |
Les résultats obtenus montrent que les performances de la spectrométrie de masse sont comparables à celles d’un système automatisé d’identification phénotypique de référence.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Abstract |
Purpose |
The aim of our study was to evaluate the capacity of MALDI-TOF mass spectrometry to identify clinical bacterial isolates, as compared to the automated identification system Vitek 2 (bioMérieux) used routinely in a teaching hospital.
Methods |
Three hundred and sixty-two strains representing 178 species from the laboratory collection were analysed by a Microflex spectrometer (Bruker Daltonics) and Vitek 2. Discrepancies between MALDI-TOF and Vitek 2 identifications were investigated by genetic identification (rrS, sodA, rpoB), considered as a reference.
Results |
Among the 362 isolates, 264 (73%) were consistently identified by Vitek 2 and Microflex. Taking into account genetic identification, we found that 44 (44.9%) of the 98 remaining isolates were correctly identified by mass spectrometry but not by Vitek 2. Conversely, 33 isolates (33.7%) were correctly identified by Vitek 2, but not by Microflex. The genetic identification of the 21 remaining isolates (21,4%) did not match either Vitek 2 or Microflex results.
Conclusion |
The performances of MALDI-TOF mass spectrometry for bacterial identification correspond to those of a reference automated identification system.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Mots clés : Identification, Spectrométrie de masse, Vitek 2
Keywords : Identification, Mass spectrometry, Vitek 2
Plan
Vol 58 - N° 1
P. 55-57 - février 2010 Retour au numéro
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