S'abonner

Variants within the calpain-10 gene and relationships with type 2 diabetes (T2DM) and T2DM-related traits among Tunisian Arabs - 19/11/10

Doi : 10.1016/j.diabet.2010.03.005 
I. Ezzidi a, N. Mtiraoui a, R. Nemr b, M. Kacem c, G.M. Al-Khateeb d, T. Mahjoub a, W.Y. Almawi d,
a Research Unit of Biology and Genetics of Hematological and Auto-immune diseases, Faculty of Pharmacy of Monastir, University of Monastir, Monastir, Tunisia 
b Endocrinology and Diabetes Service, Rizk Hospital, Beirut, Lebanon 
c Endocrinology and Diabetic Service, CHU Farhat Hached Sousse, Tunisia 
d Department Medical Biochemistry, Arabian Gulf University, PO Box 22979 Manama, Bahrain 

Corresponding author. Tel.: +973 3971 7118; fax: +973 17 271 090.

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
Article gratuit.

Connectez-vous pour en bénéficier!

Abstract

Background

Common variations in the calpain 10 (CAPN10) gene variants UCSNP-43, UCSNP-19 and UCSNP-63, and the 112/121 diplotype, are associated with an increased risk of type 2 diabetes (T2DM) and T2DM-related traits.

Methods

The association of UCSNP-43, -19 and -63 CAPN10 SNPs with T2DM was assessed in 917 Tunisian T2DM patients and 748 ethnically matched non-diabetic controls. CAPN10 genotyping was done by PCR-RFLP.

Results

Significant differences in UCSNP-19 MAF, but not UCSNP-43 or -63, and genotype distribution were seen between patients and controls. Heterogeneity in UCSNP-19, but not UCSNP-43 and -63, genotype distribution was noted according to geographical origin. Obesity was associated with UCSNP-19, while raised fasting glucose was associated with UCSNP-63, and increased HDL was associated with UCSNP-43. Enrichment of homozygous UCSNP-19 2/2 was seen in overweight and obese compared with lean patients; logistic-regression analyses demonstrated a positive association of the 2/2 genotype with overweight [P=0.003; OR (95% CI)=2.07 (1.28–3.33)] and obese [P=0.021; OR (95% CI)=1.83 (1.10–3.07)] patients. Of the six CAPN10 haplotypes identified, significant enrichment of only haplotype 111 was seen in T2DM patients [Pc=0.034; OR (95% CI)=1.22 (1.06–1.41)], while the frequency of all identified CAPN10 diplotypes, including the high-risk 112/121, was comparable between patients and controls.

Conclusion

While CAPN10 UCSNP-19 SNP and haplotype 111 contribute to the risk of T2DM in Tunisian subjects, no significant association between CAPN10 diplotypes and T2DM was demonstrated.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Préambule

Des variants communs du gène de la calpaine-10 (CAPN10), en particulier UCSNP-4, UCSNP-19 et UCSNP-63 et le diplotype à risque (combinaison haplotypique) (112/121) ont été associée à l’augmentation du risque du diabète de type 2 (DT2) et les traits associés.

Méthodes

L’association du DT2 et des SNPs UCSNP-43, UCSNP-19 et UCSNP-63 du gène CAPN10 a été étudiée chez 917 diabétiques tunisiens et 748 témoins non diabétiques de même origine. Le génotypage du gène CAPN10 a été réalisé par PCR-RFLP.

Résultats

Des différences significatives de la distribution génotypique du UCSNP-19, mais non d’UCSNP-43 et UCSNP-63 ont été observées entre les patients et les témoins. Une hétérogénéité de la distribution génotypique du UCSNP-19 mais non de celle d’UCSNP-43 et UCSNP-63 a été notée selon l’origine géographique. L’obésité était associée avec UCSNP-19, l’hyperglycémie à jeun avec UCSNP-63, alors que l’élévation du HDLc était en corrélation avec UCSNP-43. L’enrichissement d’UCSNP-19 en homozygote 2/2 a été observé chez les patients en surpoids et obèses comparés aux patients de poids normal. L’analyse par régression logistique a mis en évidence une corrélation positive entre le génotype 2/2 chez les patients en surpoids [P=0,003; OR (95 % IC)=2,07 (1,28–3,33)] et obèses [P=0,021; OR 1,83 (1,10–3,07)]. Parmi les six haplotypes de CAPN10 identifiés, un enrichissement significatif pour le seul haplotype 111 a été observé chez les DT2 [Pc=0,034; OR 1,22 (1,06–1,41)] alors que les fréquences de tous les diplotypes de CAPN10 identifiés, dont le diplotype à risque 112/121 étaient comparables entre les patients et les témoins.

Conclusions

Le variant commun UCSNP-19 SNP de CAPN10 et l’haplotype 111 contribuent au risque de DT2 chez les sujets tunisiens; aucune association significative n’a été mise en évidence entre les diplotypes de CAPN10 et le DT2.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Calpain-10, Type 2 diabetes, Polymorphism, Haplotypes, Diplotypes, Linkage stdy, Tunisian

Mots clés : Calpaine-10, Diabète de type 2,, Polymorphismes, Haplotypes, Diplotypes, Études d’association, Tunisiens


Plan


© 2010  Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
Ajouter à ma bibliothèque Retirer de ma bibliothèque Imprimer
Export

    Export citations

  • Fichier

  • Contenu

Vol 36 - N° 5

P. 357-362 - novembre 2010 Retour au numéro
Article précédent Article précédent
  • Physical exercise for the prevention and treatment of type 2 diabetes
  • C. Sanz, J.-F. Gautier, H. Hanaire
| Article suivant Article suivant
  • Effect of type 2 diabetes on plasma kallikrein activity after physical exercise and its relationship to post-exercise hypotension
  • D.F. Motta, L.C.J. Lima, G. Arsa, P.S. Russo, M.M. Sales, S.R. Moreira, P.K. Morais, W.S. Almeida, R.C. Araujo, M.R. Moraes, J.L. Pesquero, H.G. Simões, C.S.G. Campbell

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.

Mon compte


Plateformes Elsevier Masson

Déclaration CNIL

EM-CONSULTE.COM est déclaré à la CNIL, déclaration n° 1286925.

En application de la loi nº78-17 du 6 janvier 1978 relative à l'informatique, aux fichiers et aux libertés, vous disposez des droits d'opposition (art.26 de la loi), d'accès (art.34 à 38 de la loi), et de rectification (art.36 de la loi) des données vous concernant. Ainsi, vous pouvez exiger que soient rectifiées, complétées, clarifiées, mises à jour ou effacées les informations vous concernant qui sont inexactes, incomplètes, équivoques, périmées ou dont la collecte ou l'utilisation ou la conservation est interdite.
Les informations personnelles concernant les visiteurs de notre site, y compris leur identité, sont confidentielles.
Le responsable du site s'engage sur l'honneur à respecter les conditions légales de confidentialité applicables en France et à ne pas divulguer ces informations à des tiers.


Tout le contenu de ce site: Copyright © 2024 Elsevier, ses concédants de licence et ses contributeurs. Tout les droits sont réservés, y compris ceux relatifs à l'exploration de textes et de données, a la formation en IA et aux technologies similaires. Pour tout contenu en libre accès, les conditions de licence Creative Commons s'appliquent.