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Towards sugar derivatives as toxin-blocking pharmaceuticals: STD NMR spectroscopy as versatile tool for affinity assessment in drug development - 22/02/11

Doi : 10.1016/j.crci.2010.03.013 
João P. Ribeiro a, Diogo Teixeira Carvalho b, Sabine André c, F. Javier Cañada a, Ricardo José Alves b, Hans-Joachim Gabius c, Jesús Jiménez-Barbero a,
a Chemical and Physical Biology, Centro de Investigaciones Biológicas-CSIC, Ramiro de Maeztu 9, 28040 Madrid, Spain 
b Tierärztliche Fakultät, Institut für Physiologische Chemie, Ludwig-Maximilians-Universität München, Veterinärstr. 13, 80539 München, Germany 
c Faculdade de Farmácia, Universidade Federal de Minas Gerais, Av. Pres. Antônio Carlos 6627, 31270-901 Belo Horizonte, Brazil 

Corresponding author.

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Abstract

A protocol based on saturation transfer difference (STD)-NMR spectroscopy competition experiments is presented as a fast compound-screening method (30min acquisition time per compound) capable of evaluating ligand properties for the lectin site with the intention of selecting compounds for iterative refinement. Glycosides with variations in the aglycon and plant toxin viscumin (VAA) were studied systematically. The best hits were further analyzed via docking simulations to rationalize an increased affinity structurally. The strategy described can readily be extended to other medically relevant lectins.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : NMR, Molecular modelling, Viscumin, STD NMR, molecular recognition


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Vol 14 - N° 1

P. 96-101 - janvier 2011 Retour au numéro
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