Le développement de l'échoendoscopie (EE) a permis de mieux préciser l'extension pariétale et ganglionnaire des tumeurs gastro-intestinales et pancréatiques. Néanmoins, l'EE ne peut affirmer le caractère malin ou bénin d'adénopathies, de masses pancréatiques ou de compressions extrinsèques du tube digestif. Le développement depuis 7 ans de l'échoendoscopie sectorielle linéaire a permis de réaliser des biopsies guidées de telles lésions. Il semblerait qu'il soit possible de réaliser une ponction guidée sous EE avec les deux types de matériel (radial ou sectoriel-linéaire), mais la technique de ponction avec le système radial est plus longue et techniquement plus difficile et plus dangereuse car il est impossible de suivre en totalité l'aiguille à biopsie lorsque celle-ci fait issue du canal opérateur et de la guider vers la lésion. L'échoendoscope sectoriel-linéaire possède une sonde convexe électronique de petit diamètre adaptée sur un endoscope standard. Il s'agit d'un fibroscope à vision for-oblique de 60° muni d'un canal opérateur de 2 à 3,8 mm de diamètre selon les différents appareils permettant le passage d'une pince à biopsie ou d'une aiguille à biopsie. Il est possible, avec ce type de sonde sectorielle, de réaliser des ponctions-biopsies guidées. En effet, on peut suivre la progression de l'aiguille à biopsie à la sortie du canal opérateur et la guider vers la lésion à biopsier car le faisceau d'ultrasons est émis longitudinalement par rapport à l'axe de l'endoscope et non perpendiculairement comme dans les échoendoscopes rotatifs. Les principales indications de la ponction guidée sous EE sont le diagnostic d'adénopathies ou de masses médiastinales, coeliaques et pelviennes, au niveau de tumeurs sous-muqueuses, de linites gastriques avec biopsie endoscopique négative et au niveau de tumeurs pancréatiques. Les meilleurs résultats sont obtenus au niveau des masses ganglionnaires, des récidives anastomotiques et des compressions extrinsèques ainsi qu'au niveau des tumeurs pancréatiques. Pour ces dernières, le rendement de la biopsie guidée sous EE est meilleur pour les lésions de petite taille (< 4 cm). En effet, les cancers plus volumineux sont le siège de nécrose et/ou de fibrose intratumorale responsable de la non-productivité du prélèvement. L'obtention d'une « microbiopsie » permet un diagnostic histologique plus précis et une caractérisation tissulaire précise dans environ 80 % des cas pour le diagnostic de malignité. Par ailleurs, certaines équipes préconisent la présence d'un anatomopathologiste en salle afin de s'assurer de la bonne qualité du prélèvement. Il n'existe aucune publication dans la littérature concernant le risque d'essaimage avec cette technique de prélèvement. Les résultats de la littérature montrent une sensibilité globale de la technique variant entre 76 et 91 %, une spécificité de 84 à 100 % et une fiabilité de 78 à 94 %. Une étude prospective regroupant 457 patients de quatre centres (Indianapolis, Copenhague, Marseille et Orange en Californie) a montré que la sensibilité de la ponction était statistiquement meilleure pour les ganglions (94 %) et les tumeurs extraluminales (86 %) que pour les lésions pariétales (tumeurs sous-muqueuses et gros plis gastriques) (61 % ; p < 0,001).