Les données de la biologie moléculaire et de la génomique ont permis, depuis ces 25 dernières années, d'apporter quelques lueurs sur les évènements impliqués dans l'embryogenèse en général, mais aussi en particulier en ce qui concerne les organes qui comportent différents types cellulaires mais proviennent d'une ébauche primordiale commune. C'est en particulier le cas de l'axe hypothalamohypophysaire. Le développement de l'hypophyse, comme celui de l'hypothalamus, est en effet un modèle particulièrement intéressant dans la mesure où l'organe adulte provient de la maturation de différents types cellulaires à partir d'un progéniteur commun de nature ectodermique. Ces études insistent sur l'importance des facteurs de transcription et des molécules de signalisation. L'un comme l'autre sont impliqués dans des processus de signalisation spatiale jouant sur des gradients moléculaires opposés. Il existe ainsi en particulier une véritable distribution combinatoire responsable de la double polarité rostrocaudale et dorsoventrale, en fonction de quoi les types cellulaires se mettent en place spécifiquement. Il existe par ailleurs des processus d'activation et de répression au niveau du code transcriptionnel, avec possibilité de chevauchement plus ou moins complet, pour certains des gènes cibles. Ainsi différenciation et prolifération cellulaires sont-elles soumises à ces trois phénomènes : activation, répression, recouvrement. Vient s'y ajouter la découverte d'un nombre croissant de complexes de corégulation, qui s'intègrent à l'ensemble des signaux informatifs au niveau de la transcription génique.