La fluorescence est la propriété physique qu'ont certains corps d'émettre un rayonnement d'une longueur d'onde supérieure à celle d'un rayonnement incident dit d'excitation. Un fluorochrome est caractérisé par ses spectres d'excitation et d'émission et son rendement quantique. Un microscope équipé en épifluorescence associe un filtre d'excitation, un miroir dichroïque et un filtre d'émission. L'association des filtres doit être adaptée aux caractéristiques physiques du fluorochrome utilisé. En biologie médicale, les plus fréquemment utilisés sont l'isothiocyanate de fluorescéine, la rhodamine, l'auramine et l'acridine orange.

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