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Morphometric identification of individuals when there are more shape variables than reference specimens: A case study in Galápagos tortoises - 05/01/12

Doi : 10.1016/j.crvi.2011.10.007 
Ylenia Chiari a, , b , Julien Claude b
a CIBIO, Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos Campus Agrário de Vairão, 4485-661 Vairão, Portugal 
b Institut des Sciences de l’Évolution, CNRS-UMR no 5554, CC 064, Université Montpellier 2, 2, place Eugène-Bataillon, 34095 Montpellier cedex 5, France 

Corresponding author.

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Abstract

Molecular biology techniques are useful for taxonomic assignment, but they are not always accessible and can be expensive and time consuming to perform. Morphological methods to identify the origin of individuals could be valuable if they can be performed rapidly, accurately, and with minimal resources. In order to correctly assign the origin of individuals from two distinct tortoise lineages, we studied here the accuracy of shape statistics depending on the inclusion of different numbers of shape components. Misleading assignment may occur if an optimal balance between the number of shape variables and the number of sampled individuals is not respected, especially when more variables than specimens are available. Assignment of museum samples of unknown origin suggests that they mostly belong to only one of the two lineages.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Les techniques de biologie moléculaire permettent facilement d’assigner des individus à des unités taxonomiques ou populationnelles. Cependant, ces méthodes, parfois onéreuses en temps et en argent, ne sont pas dans certaines conditions utilisables. Ainsi, la morphométrie reste utile si elle permet de rapidement identifier des spécimens de musée ou de terrain avec une certaine fiabilité. Afin d’assigner des spécimens à deux populations de tortues, nous étudions ici le degré de précision de ces méthodes par rapport au nombre de variables morphométriques incluses dans l’analyse. Nous montrons qu’il est nécessaire de sélectionner un nombre de variables optimal en fonction du nombre d’individus de référence pour limiter l’erreur d’identification, ce qui est particulièrement important quand le nombre des variables excède le nombre d’individus de référence. Les tortues identifiées dans cette étude appartiennent certainement à une seule des lignées.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Cross-validation calculation, Morphometrics, Museum specimens, Photogrammetry, Turtles

Mots clés : Validation croisée, Morphométrie, Spécimens muséologiques, Photogrammetrie, Tortues


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Vol 335 - N° 1

P. 62-68 - janvier 2012 Retour au numéro
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  • Genetics and taxonomy of Chilean smooth-shelled mussels, Mytilus spp. (Bivalvia: Mytilidae)
  • Philippe Borsa, Vincent Rolland, Claire Daguin-Thiébaut
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  • Diversity and ecological characteristics of vascular flora in Mediterranean temporary pools
  • Simonetta Bagella, Maria Carmela Caria

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