El tratamiento médico de la úlcera genital (UG) suele plantear dificultades. En la UG aguda, la clínica no correlaciona con el microorganismo causal. El herpes es la primera causa de UG aguda, pero siempre se ha de temer una sífilis, aunque la microscopia de campo oscuro resulte negativa, y administrar un tratamiento probabilístico sin aguardar el resultado de los cultivos. El linfogranuloma venéreo se sitúa en tercer lugar de frecuencia. Sólo se consideran los demás diagnósticos si fracasa el tratamiento de las tres causas principales. Cuando una UG evoluciona durante más de un mes, un dermatólogo debe realizar una biopsia para su estudio histológico y por inmunofluorescencia.