Les souches multirésistantes du genre Acinetobacter avec en particulier Acinetobacterbaumannii sont connues pour leur capacité à essaimer parmi les patients dans les hôpitaux. Le typage de ces bactéries en milieu hospitalier peut se révéler important pour établir les cas d’infections croisées, pour identifier leurs origines et leurs modalités de dissémination. En marge du milieu hospitalier, le typage est important pour décrire la diversité et la diffusion de ces bactéries dans de larges distances géographiques. Les méthodes initiales de typage étaient phénotypiques, utilisant la lysotypie, le sérotypage et la biotypie. De ces méthodes la biotypie est encore utile pour attribuer à certains biotypes des souches selon un schéma défini. L’antibiotypie peut aussi être utilisée pour un « screening » des souches à identifier, mais les résultats doivent être interprétés avec prudence car les profils de sensibilité peuvent se modifier en fonction d’acquisitions ou de perte de gènes de résistance. Actuellement les méthodes les plus utilisées sont génotypiques, telles que le typage par PCR, l’électrophorèse en champ pulsé (PFGE), le ribotypage, et l’analyse génomique par AFLP (analyse du polymorphisme génomique par amplification de fragments) ; le typage par PCR est une méthode de screening facile mais de reproductibilité limitée. Les 3 autres méthodes sont plus fiables et permettent d’établir des « librairies » de données, bien que l’AFLP ne permette pas des comparaisons inter-laboratoires. Un nouveau développement utilise des méthodes de typage basées sur des séquences « multilocus » et la possibilité de leur usage en remplacement des méthodes génotypiques actuelles est attendu dans les prochaines années. Le système de typage de « multilocus sequence » a été décrit pour Acinetobacter, mais son utilité reste à tester sur de grands nombres de souches.

Multidrug resistant strains of the genus Acinetobacter with Acinetobacter baumannii in particular are notorious for their ability to spread among patients in hospitals. Typing of these organisms at the hospital level may be important to assess cases of cross-infections, or to identify the sources and modes of spread of the organisms. Typing beyond the hospital level may be important to assess the diversity and spread of these organisms over wide geographic areas. Early methods for typing acinetobacters included phenotypic methods like phage typing, serotyping and biotyping. Of these, biotyping is still useful as an accessory method to allocate strains to types of a defined scheme. Antibiogram typing may be of use to screen strains for identity, but results have to be interpreted with caution since susceptibility profiles of strains may change due to acquisition or loss of resistance genes. Currently, the most frequent typing methods are genotypic methods like PCR-based fingerprinting, macrorestriction analysis by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), ribotyping and whole genomic analysis by AFLP. PCR-fingerprinting is useful as an easy screening method but its reproducibility is limited. PFGE, ribotyping and AFLP are more robust methods which may be used to set up databases, although AFLP fingerprints cannot be compared between laboratories. A new development is to use sequence based typing methods and it is expected that these will replace current fragment based genotypic methods in the coming years. A multilocus sequence typing system has already been described for Acinetobacter but its usefulness still has to be tested with large numbers of strains.