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Predicting dengue outbreaks using approximate entropy algorithm and pattern recognition - 29/05/13

Doi : 10.1016/j.jinf.2013.03.012 
Chia-Chern Chen a, b, Hsien-Chang Chang b,
a Department of Family Medicine, St. Martin de Porres Hospital, Chiayi, Taiwan 
b Biosensor LAB, Department of Biomedical Engineering, National Cheng Kung University, No. 1, University Rd., Tainan City 701, Taiwan 

*Corresponding author. Tel.: +886 6 275 7575x63426; fax: +886 6 276 0697.

Summary

Objectives

The prediction of dengue outbreaks is a critical concern in many countries. However, the setup of an ideal prediction system requires establishing numerous monitoring stations and performing data analysis, which are costly, time-consuming, and may not achieve the desired results. In this study, we developed a novel method for predicting impending dengue fever outbreaks several weeks prior to their occurrence.

Methods

By reversing moving approximate entropy algorithm and pattern recognition on time series compiled from the weekly case registry of the Center for Disease Control, Taiwan, 1998–2010, we compared the efficiencies of two patterns for predicting the outbreaks of dengue fever.

Results

The sensitivity of this method is 0.68, and the specificity is 0.54 using Pattern A to make predictions. Pattern B had a sensitivity of 0.90 and a specificity of 0.46. Patterns A and B make predictions 3.1 ± 2.2 weeks and 2.9 ± 2.4 weeks before outbreaks, respectively.

Conclusions

Combined with pattern recognition, reversed moving approximate entropy algorithm on the time series built from weekly case registry is a promising tool for predicting the outbreaks of dengue fever.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Dengue, Disease outbreaks, Environmental monitoring, Entropy, Pattern recognition, Prevention & control, Infection, Aedes


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Vol 67 - N° 1

P. 65-71 - juillet 2013 Retour au numéro
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