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Prevalence, identification by a DNA microarray-based assay of human and food isolates Listeria spp. from Tunisia - 21/02/14

Doi : 10.1016/j.patbio.2013.10.005 
F. Hmaïed a, , S. Helel a, V. Le berre b, J.-M. François b, A. Leclercq c, M. Lecuit c, H. Smaoui d, A. Kechrid d, A. Boudabous e, I. Barkallah a
a Laboratoire de microbiologie et biologie moléculaire, CNSTN, pôle technologique, 2020 Sidi Thabet, Tunisia 
b Plateforme biopuces du génopôle, Insa, CNRS 5504, Inra 792, 135, avenue de Rangueil, 31077 Toulouse cedex 04, France 
c Institut Pasteur, French National Reference Centre and WHO Collaborating Centre for Listeria, 25-28, rue du Docteur-Roux, 75724 Paris cedex 15, France 
d Laboratoire de bactériologie de l’hôpital d’enfant de Tunis-Bab Saadoun, 1006 Tunis, Tunisia 
e Unité de microbiologie et biomolécules actives, faculté de sciences, campus universitaire, 2092 Tunis, Tunisia 

Corresponding author.

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Abstract

Objectives

We aimed at evaluating the prevalence of Listeria species isolated from food samples and characterizing food and human cases isolates.

Material and methods

Between 2005 and 2007, one hundred food samples collected in the markets of Tunis were analysed in our study. Five strains of Listeria monocytogenes responsible for human listeriosis isolated in hospital of Tunis were included. Multiplex PCR serogrouping and pulsed field gel electrophoresis (PFGE) applying the enzyme AscI and ApaI were used for the characterization of isolates of L. monocytogenes. We have developed a rapid microarray-based assay to a reliable discrimination of species within the Listeria genus.

Results

The prevalence of Listeria spp. in food samples was estimated at 14% by using classical biochemical identification. Two samples were assigned to L. monocytogenes and 12 to L. innocua. DNA microarray allowed unambiguous identification of Listeria species. Our results obtained by microarray-based assay were in accordance with the biochemical identification. The two food L. monocytogenes isolates were assigned to the PCR serogroup IIa (serovar 1/2a). Whereas human L. monocytogenes isolates were of PCR serogroup IVb, (serovars 4b). These isolates present a high similarity in PFGE. Food L. monocytogenes isolates were classified into two different pulsotypes. These pulsotypes were different from that of the five strains responsible for the human cases.

Conclusion

We confirmed the presence of Listeria spp. in variety of food samples in Tunis. Increased food and clinical surveillance must be taken into consideration in Tunisia to identify putative infections sources.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Buts de l’étude

L’objectif de ce travail est d’évaluer la prévalence de Listeria spp. dans différentes matrices alimentaires et de caractériser des isolats alimentaires et humains.

Matériel et méthodes

Entre 2005 et 2007, 100 échantillons alimentaires prélevés dans les marchés de Tunis ont été analysés ; cinq souches humaines de Listeria monocytogenes ont été étudiées. La caractérisation des isolats de L. monocytogenes a été réalisée par multiplex PCR sérogroupage et par électrophorèse sur gel en champ pulsé (PFGE) appliquant l’enzyme Ascl et Apal. Nous avons développé une puce à ADN afin de différencier les espèces au sein du genre Listeria.

Résultats

La prévalence de Listeria spp. dans les échantillons alimentaires a été estimée à 14 %. Deux isolats ont été identifiés L. monocytogenes et 12 L. innocua. La méthode de puce à ADN par sa précision a permis de distinguer entre les différentes espèces de Listeria spp. Les résultats étaient conformes à l’identification biochimique. Les isolats alimentaires de Lmonocytogenes ont été assignés au sérogroupe IIa (sérovar 1/2a). Cependant, les isolats humains ont été assignés au sérogroupe IVb (sérovars 4b). Ces isolats ont présenté une similarité importante par PFGE. Les isolats alimentaires de L. monocytogenes ont été classés en deux pulsotypes différents. Ces pulsotypes étaient différents de celui des souches humaines.

Conclusion

Nos résultats confirment la présence de Listeria spp. dans différentes matrices alimentaires collectées à Tunis. Des efforts supplémentaires devraient être déployés afin de prendre en considération le risque de toxi-infections alimentaires liées à L. monocytogenes et d’identifier les sources potentielles d’infection.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Listeria monocytogenes, PFGE, Microarray-based assay, iap, Tunis

Mots clés : Listeria monocytogenes, PFGE, Puce à ADN, iap, Tunis


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