Les infections respiratoires aiguës constituent un motif fréquent d’hospitalisation. Le diagnostic de l’agent causal nécessite la réalisation rapide des prélèvements pour permettre une prise en charge efficace des patients. L’identification du germe n’est pas toujours concluante d’où l’intérêt de la connaissance de l’épidémiologie microbienne.

Il s’agit d’une étude prospective incluant les malades hospitalisés au service de pneumologie du CHU de Marrakech de novembre 2022 à août 2023 et qui présentent des signes cliniques évocatrices d’infection respiratoire et chez qui l’examen cytobactériologique des expectorations n’a pas identifié de germe, nous avons réalisé une PCR multiplex pour l’identification du germe responsable.

Cinquante-quatre patients ont été inclus, d’âge moyen de 54 ans, une nette prédominance masculine avec un sex-ratio de 1,16,6 pneumonies, 4 bronchopneumonies, 6 carcinomes bronchiques surinfectés, 8 cas de surinfection de DDB, 6 cas d’exacerbation de PID, 4 cas d’exacerbation d’asthme, 6 pyothorax, 11 exacerbations de BPCO, 3 pneumothorax avec surinfection bronchique. La PCR respiratoire panel haut a été réalisé chez tous nos patients, elle est revenue négative chez 17 cas (31 %), nous avons mis en évidence une infection virale seule chez 23 cas (21 %) : 11 cas Influenzae A, 7 cas de Influenzae B, 3 cas de Virus Respiratoire Syncitial, 2 cas de SARS COV 2. une PCR panel bas a été faite dans 20 cas (37 %) ; elle est revenue négative dans 8 cas (40 %), une infection bactérienne seul a été détectée dans 4 cas (20 %) : 1 cas d’HI, 3 cas de pneumocoque, L’association d’infection virale et bactérienne a été noté dans 8 cas (40 %) ; 4 cas de streptocoque, 2 cas d’HI, 1 Klebsiella pneumoniae, 1 cas d’Escherichia coli.

Après l’ère de la COVID-19 et l’avènement du vaccin anti-SARS cov 2 on constate un changement de l’écologie microbienne des infections respiratoires. Les germes les plus fréquemment en cause sont le Streptococcus pneumoniae, Influenza A, Mycoplasma pneumoniae, Hemophilus influenzae.