Haemophilus influenzae (Hi) est une bactérie sous forme de coccobacille à Gram négatif dont l'homme est le seul hôte naturel connu. Cette bactérie colonise les surfaces muqueuses comme les voies respiratoires et fait partie du microbiote oropharyngé. La transmission est aérogène et le portage rhinopharyngé est généralement asymptomatique. Hi peut provoquer des infections respiratoires comme les otites, sinusites, pharyngites et bronchopneumonies, mais aussi des conjonctivites et des infections urogénitales. Les infections invasives à H. influenzae se produisent lorsque la bactérie envahit la circulation sanguine, se propage aux sites normalement stériles et provoque une pneumonie bactériémique, une épiglottite, une arthrite ou une méningite bactérienne aiguë. La croissance dépendante de l'hémine et le nicotinamide adénine dinucléotide est caractéristique. L'antibiogramme révèle une augmentation de la résistance aux bêtalactamines, y compris les céphalosporines de troisième génération. Outre le sérotypage qui reflète l'identité de la capsule, le typage génétique approfondi par séquençage d'ADN (acide désoxyribonucléique) est utilisé pour la surveillance épidémiologique. Hi est divisé en deux grandes catégories : souches capsulées et non capsulées. La capsule détermine le sérotype et c'est le serotype b (Hib) qui est le plus pathogène chez l'homme, affectant principalement les nourrissons et les jeunes enfants. Au début des années 1990, le vaccin conjugué contre le sérotype b a été introduit dans la plupart des pays européens et l'incidence des infections invasives à Hib a considérablement baissé mais semble réémerger depuis plusieurs années, en particulier en France. Les autres sérotypes (a, c, d, e et f) peuvent provoquer des infections invasives. Le sérotype a semble en augmentation. Les souches non capsulées, également appelées « non typables » (NT), causent habituellement des infections non invasives des voies respiratoires supérieures, telles que l'otite moyenne et la sinusite. Cependant, les souches HiNT peuvent être responsables d'infections invasives et montrent une grande diversité génétique.