È necessario distinguere le congiuntiviti del neonato da quelle del bambino, poiché esistono caratteristiche specifiche per ciascuna fascia d'età. È necessario considerare la possibilità di infezioni sessualmente trasmissibili nel neonato e di imperforazione dei dotti lacrimali in caso di lacrimazione quotidiana del lattante. Nei bambini più grandi, le congiuntiviti infettive richiedono nella maggior parte dei casi un trattamento sintomatico e il rispetto delle norme igieniche per limitare la trasmissione tramite le mani. Si ricorre agli antibiotici topici solo in caso di segni di gravità. Il trattamento è inizialmente empirico e non richiede alcun prelievo. Il fondamento del trattamento delle allergie consiste nell'eliminazione dell'allergene e in lavaggi abbondanti.