Bien que l'association entre mammifères chiroptères (chauves-souris) et champignons pathogènes ait été rapportée depuis longtemps en zone tropicale, une telle étude à notre connaissance n'a jamais été réalisée en Europe. L'analyse de la flore fongique associée à des chauves-souris européennes a donc été entreprise dans les Pays de la Loire (France) afin de déterminer si ces animaux hébergent d'éventuelles espèces pathogènes pour l'homme ou les animaux domestiques.

Cent sept prélèvements de pelage de chauve-souris appartenant à six espèces différentes, ou de guano, ont ainsi été effectués dans des cavernes de l'Ouest de la France, lors du recensement national annuel réalisé pendant la période d'hibernation des animaux. Ces prélèvements se répartissaient en 82 échantillons de guano et 25 écouvillonnages du pelage. Les cultures ont révélé une flore fongique d'une grande diversité, encore plus prononcée pour les Rhinolophidés que pour les Vespertilionidés. Parmi les champignons potentiellement pathogènes, des levures du genre Candida ( C. glabrata et C. guilliermondii ) ont été identifiées, ainsi que huit espèces de champignons kératinophiles : Trichophyton terrestre, Scopulariopsis brevicaulis, Aphanoascus fulvescens, Myceliophthora thermophila, Chrysosporium lobatum, Chrysosporium merdarium, Chrysosporium pseudomerdarium et Chrysosporium pruinosum . En outre, un champignon ressemblant à Histoplasma capsulatum a été isolé. Une identification approfondie est aujourd'hui en cours pour ce qui pourrait être le premier isolement de cette espèce dans l'environnement en France.

Ces observations démontrent que plusieurs espèces fongiques pathogènes pour l'homme ou les animaux domestiques sont associées aux chauves-souris. En outre, leur habitude de se rassembler, parfois en très grand nombre dans certaines cavernes, contribue à créer un environnement favorable à la prolifération de ces champignons par l'apport d'éléments tels que déchets kératiniques, déjections ou cadavres de chauve-souris. Cependant, nous pensons que l'habitat particulier des chauves-souris fait qu'elles ne constituent pas un réel danger pour la santé humaine ou animale.

Although the association between tropical bats and pathogenic fungi has been reported long ago, no study has been performed in Europe to our knowledge. The fungal biota associated with European Chiroptera in the region of Pays de la Loire (Western France) was therefore analyzed to determine if these mammals harbor fungi pathogenic for humans or household animals.

One hundred and seven samples of guano or hair/skin coming from six bat species were collected from caverns of Western France during the national annual counting of Chiroptera performed in the course of the hibernation period. They consisted of 82 samples of guano and 25 samples of hair/skin swabs. Mycological analysis of these samples revealed the great diversity of the fungal biota, more pronounced for Rhinolophidae Chiroptera than for Vespertilionidae. Among the pathogenic fungi, yeasts of Candida genus ( C. glabrata and C. guilliermondii ) and eight species of keratinophilic fungi ( Trichophyton terrestre, Scopulariopsis brevicaulis, Aphanoascus fulvescens, Myceliophthora thermophila, Chrysosporium lobatum, Chrysosporium merdarium, Chrysosporium pseudomerdarium and Chrysosporium pruinosum ) were identified. In addition, an Onygenaceae highly resembling Histoplasma capsulatum was isolated.

Our results demonstrate that several human or animal pathogenic fungi may be associated with bats. Moreover, their habit to gather, sometimes in vast colonies in certain caverns, creates an environmental medium suitable for the proliferation of these fungi by enrichment of the soil with hair, skin, feces and bats corpses. However, due to the particular habitat of these animals, one may consider from this study that bats do not constitute a real danger for human or animal health.