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Microbiote intestinal - 12/01/17

[90-05-0214-A]  - Doi : 10.1016/S2211-9698(16)75692-5 
N. Grall a, b, c, , A. Andremont a, b, c, E. Ruppé d
a Inserm, IAME, UMR 1137, 75018 Paris, France 
b Université Paris-Diderot, IAME, UMR 1137, Sorbonne-Paris-Cité, 75018 Paris, France 
c Laboratoire de microbiologie, Hôpital Bichat-Claude-Bernard, AP-HP, 46, rue Henri-Huchard, 75018 Paris, France 
d Laboratoire de recherche génomique, Hôpitaux universitaires de Genève, rue Gabrielle Perret-Gentil, 4, 1205 Genève, Suisse 

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Résumé

Le microbiote intestinal humain est composé de 1013 à 1014 bactéries et constitue en cela notre principal réservoir bactérien. Le développement des nouvelles méthodes de séquençage à haut débit a permis d'approfondir considérablement nos connaissances sur cet organe métabolique méconnu, notamment vis-à-vis de ses liens avec un certain nombre de pathologies intestinales (maladies inflammatoires du tube digestif, cancer du côlon) et extra-intestinales (par exemple le diabète sucré, l'obésité, l'asthme ou l'autisme). Le microbiote intestinal est aussi un réservoir majeur de bactéries résistant aux antibiotiques, qui peut être enrichi par des bactéries multirésistantes comme les entérobactéries productrices de bêta-lactamases à spectre élargi ou de carbapénèmases. La prise d'antibiotiques joue un rôle majeur dans ces phénomènes en altérant la diversité des populations du microbiote intestinal (et notamment l'effet barrière qu'elles exercent) et en augmentant les densités intestinales des bactéries résistantes. Ainsi, de nombreuses méthodes ciblant le microbiote intestinal et visant à préserver ou restaurer son intégrité sont en développement et constituent autant de pistes intéressantes dans la lutte contre la résistance aux antibiotiques. Dans cette revue sont abordés en parallèle la description et les méthodes d'étude du microbiote intestinal et de son résistome ainsi que l'effet des antibiotiques sur ces deux compartiments et les pathologies associées aux perturbations du microbiote intestinal. Enfin, sont détaillées les pistes abordées pour maintenir ou restaurer l'intégrité de ce microbiote.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots-clés : Microbiote intestinal, Résistome, Métagénomique, Antibiorésistance, Dysbiose, Transplantation fécale


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