Allelic frequency variation of ACKR1 in Three Algerian Populations: Zenata, Reguibat, and Oran - 19/10/23
, Deba Tahria 1, 2, 3, Bekada Asmahan 4, Meroufel Sebaa Djabaria Naima 1, Mediene Benchekor Sounnia 1, 4, Benhamamouch Soraya 4Cet article a été publié dans un numéro de la revue, cliquez ici pour y accéder
Highlights |
• | The Duffy blood group system plays a critical role in immune response and physiological processes. |
• | This study investigates the distribution of the Duffy blood group in three Algerian populations: Zenata, Reguibat, and Oranian. |
• | Genetic analysis revealed the presence of a silent allele in all three populations, with a significant frequency in the Zenata population (78.03%). |
• | A rare allele, FY X, was exclusively detected in the Reguibate population (frequency of 0.75%). |
• | This study provides valuable insights into the allele and genotypic frequencies of the Duffy system in the Zenata and Reguibat populations, contributing to our understanding of the genetic history of the Algerian population. |
Abstract |
Introduction |
The discovery of the Duffy antigen is of great significance, given its essential role in immune response and various physiological processes. Genetic mutations in the Duffy gene not only affect antigen expression but also result in different antigen types. This underscores the importance of genetic characterization for clinical studies and exploring genetic diversity within the population. This study primarily aims to genetically characterize the Duffy blood group within three Algerian populations: the Zenata, Reguibat, and Oran populations.
Methods The genetic polymorphism of the Duffy erythrocyte group was examined, focusing on five allelic versions of the ACKR1 locus: FY*01, FY*02, FY*X, and silent alleles FY*01N.01 and FY*02N.01. A total of 223 Algerian individuals, including 90 from the Oran population, 66 from the Zenata population, and 67 from the Reguibat population, were analyzed using the polymerase chain reaction with sequence-specific primer (PCR-SSP) method.
The results revealed the presence of the silent alleles (FY*01N.01 and FY*02N.01) in all three populations, with a total frequency of 78.03% in the Zenata population. Additionally, the FY*X allele was exclusively detected in the Reguibat population, with a frequency of 0.75%
Conclusion This study provides valuable insights into the allele and genotypic frequencies of the Duffy system in the Zenata, Reguibat and Oranpopulations, contributing to our understanding of the genetic history and origins of the Algerian population. Further research incorporating additional genetic markers and establishing a comprehensive database would enhance our knowledge in this area.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Abstract |
Introduction |
La découverte de l'antigène Duffy revêt une grande importance, compte tenu de son rôle essentiel dans la réponse immunitaire et divers processus physiologiques. Les mutations génétiques dans le gène duffy n'affectent pas seulement l'expression de l'antigène, mais entraînent également la formation de différents types d'antigènes. Cela souligne l'importance de la caractérisation génétique pour les études cliniques et l'exploration de la diversité génétique au sein de la population. Cette étude vise principalement à caractériser génétiquement le groupe sanguin Duffy au sein de trois populations algériennes : les Zenata, les Reguibat et d’Oran.
Methodes Cette étude visait à étudier la répartition du groupe sanguin Duffy dans trois populations algériennes : les populations Zenata, Reguibat et Oran. Le polymorphisme génétique du groupe érythrocytaire Duffy a été examiné en se concentrant sur cinq versions alléliques du locus ACKR1 : FY*01, FY*02, FY*0X, ainsi que les allèles silencieux FY*01N.01 et FY*02N.01. Un total de 223 individus algériens, comprenant 90 individus de la population d’Oran 66 individus de la population Zenata et 67 individus de la population Reguibat, ont été analysés à l'aide de la méthode de réaction en chaîne par polymérase avec amorces spécifiques de séquence (PCR-SSP).
Les résultats ont révélé la présence des allèles silencieux (FY*01N.01 et FY*02N.01) dans les trois populations, avec une fréquence globale des deux alleles silencieux de 78,03% dans la population Zenata. De plus, l'allèle FY*X a été détecté exclusivement dans la population Reguibate, avec une fréquence de 0,75%.
Conclusion Cette étude offre des informations précieuses sur les fréquences alléliques et génotypiques du système Duffy dans les populations Zenata, Reguibat et oran, contribuant ainsi à notre compréhension de l'histoire génétique et des origines de la population algérienne. Des recherches supplémentaires intégrant des marqueurs génétiques supplémentaires et l'établissement d'une base de données complète permettraient d'améliorer nos connaissances dans ce domaine.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Keywords : duffy blood group system, PCR-SSP, silent allele, Zenata, Reguibat
Mot clés : groupe sanguin duffy, allele silencieux, Zenata, Reguibat
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