Méthodes d'analyse de la sensibilité des virus aux antiviraux : tests phénotypiques et génotypiques - 27/11/08

Michel Segondy

aCorrespondance : Laboratoire de virologie Hôpital Saint-Eloi Centre hospitalier universitaire 34295 Montpellier cedex 5

Résumé

La sensibilité (ou la résistance) d'une souche virale à une molécule antivirale peut être évaluée par deux types de tests.

Les tests phénotypiques permettent de définir le caractère sensible ou résistant du virus par culture de celui-ci en présence d'une gamme de concentrations de l'antiviral à étudier ; on détermine ainsi des concentrations inhibitrices (Cl50, Cl90). Ces tests, longs et fastidieux, sont réservés à des laboratoires spécialisés.

Les tests génotypiques sont basés sur l'identification de mutations conférant au virus un caractère de résistance. Ces mutations sont détectées par des techniques de biologie moléculaire (PCR, sondes nucléiques, séquençage). Ces tests qui ne nécessitent pas une culture virale préalable donnent un résultat rapide. Le développement des tests génotypiques en virologie clinique est facilité par la disponibilité de trousses commercialisées.

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Summary

Two kinds of biological tests may be used for evaluating viral susceptibility (or resistance) to antiviral drugs.

In phenotypic tests, the susceptible or resistant character of a viral strain to an antiviral drug is evaluated by determination of the inhibitory concentrations (IC50, IC90). This determination is based on viral culture in presence of a range of drug concentrations. These fastidious tests are only performed in specialized laboratories.

Genotypic tests are based on identification of mutations that confer viral resistance. These mutations can be detected by molecular biology technics (PCR, nucleic probes, sequencing). These tests, which are performed without previous viral culture are rapid. The availability of commercial tests for identification of resistance mutations can now facilitate the development of these tests in routine activity.

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Keyword : virus, antiviraux, résistance, tests phénotypiques, tests génotypiques

Key-words : virus, antiviral drugs, resistance, phenotypic tests, genotypic tests


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Vol 1998 - N° 305

P. 25-30 - septembre 1998 Retour au numéro
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