S'abonner

Contribution of common variants of ENPP1, IGF2BP2, KCNJ11, MLXIPL, PPARγ, SLC30A8 and TCF7L2 to the risk of type 2 diabetes in Lebanese and Tunisian Arabs - 13/11/12

Doi : 10.1016/j.diabet.2012.05.002 
N. Mtiraoui a, b, 1, A. Turki a, 1, R. Nemr c, A. Echtay d, I. Izzidi a, G.S. Al-Zaben e, N. Irani-Hakime f, S.H. Keleshian f, T. Mahjoub a, W.Y. Almawi e,
a Research Unit of Biology and Genetics of Hematological and Autoimmune diseases, Faculty of Pharmacy, University of Monastir, Monastir, Tunisia 
b Higher Institute of Biotechnology of Monastir, Monastir, Tunisia 
c University Medical Center Rizk Hospital, Beirut, Lebanon 
d Rafic Hariri University Hospital, Beirut, Lebanon 
e Department of Medical Biochemistry, Arabian Gulf University, Manama, Bahrain 
f St. Georges University Hospital, Beirut, Lebanon 

Corresponding author. Tel.: +973 39717118; fax: +973 17271090.

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
Article gratuit.

Connectez-vous pour en bénéficier!

Abstract

Background

While several type 2 diabetes mellitus (T2DM) susceptibility loci identified through genome-wide association studies (GWAS) have been replicated in many populations, their association in Arabs has not been reported. For this reason, the present study looked at the contribution of ENNP1 (rs1044498), IGF2BP2 (rs1470579), KCNJ11 (rs5219), MLXIPL (rs7800944), PPARγ (rs1801282), SLC30A8 (rs13266634) and TCF7L2 (rs7903146) SNPs to the risk of T2DM in Lebanese and Tunisian Arabs.

Methods

Study subjects (case/controls) were Lebanese (751/918) and Tunisians (1470/838). Genotyping was carried out by the allelic discrimination method.

Results

In Lebanese and Tunisians, neither ENNP1 nor MLXIPL was associated with T2DM, whereas TCF7L2 was significantly associated with an increased risk of T2DM in both the Lebanese [P<0.001; OR (95% CI): 1.38 (1.20–1.59)] and Tunisians [P<0.001; OR (95% CI): 1.36 (1.18–1.56)]. Differential associations of IGF2BP2, KCNJ11, PPARγ and SLC30A8 with T2DM were noted in the two populations. IGF2BP2 [P=1.3×10−5; OR (95% CI): 1.66 (1.42–1.94)] and PPARγ [P=0.005; OR (95% CI): 1.41 (1.10–1.80)] were associated with T2DM in the Lebanese, but not Tunisians, while KCNJ11 [P=8.0×10−4; OR (95% CI): 1.27 (1.09–1.47)] and SLC30A8 [P=1.6×10−5; OR (95% CI): 1.37 (1.15–1.62)] were associated with T2DM in the Tunisians, but not Lebanese, after adjusting for gender and body mass index.

Conclusion

T2DM susceptibility loci SNPs identified through GWAS showed differential associations with T2DM in two Arab populations, thus further confirming the ethnic contributions of these variants to T2DM susceptibility.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

But

Bien que plusieurs loci de susceptibilité au diabète de type 2 (DT2), identifiés par des études d’associations pangénomiques (GWAS), soient répliqués dans de nombreuses populations, leur association au DT2 dans les populations arabes n’a été pas signalée. Notre objectif était de tester la contribution des SNPs à risque au DT2, rs1044498 (ENNP1), rs1470579 (IGF2BP2), rs5219 (KCNJ11), rs7800944 (MLXIPL), rs1801282 (PPARγ), rs13266634 (SLC30A8), et rs7903146 (TCF7L2) dans deux populations arabes, libanaise et tunisienne.

Méthodes

Notre étude (cas/témoin) regroupe des sujets libanais (751/918) et tunisiens (1470/838). Le génotypage a été effectué par la méthode de discrimination allélique.

Résultats

Dans la population libanaise et tunisienne, ni ENNP1, ni MLXIPL n’étaient associés au DT2, contrairement à TCF7L2 qui était significativement associé à un risque accru au DT2 aussi bien dans la population libanaise [P<0,001 ; OR (IC 95 %), 1,38 (1,20-1,59)] que tunisienne [P<0,001 ; OR (IC 95 %), 1,36 (1,18–1,56)]. Des différences d’associations des SNPs des gènes IGF2BP2, KCNJ11, PPARγ, et SLC30A8 au DT2 étaient détectées dans les deux populations. Les SNPs des gènes IGF2BP2 [P=1,3×10−5; OR (IC 95 %), 1,66 (1,42–1,94)] et PPARγ [P=0,005 ; OR (IC 95 %), 1,41 (1,10–1,80)] n’étaient associées au DT2 que chez les sujets libanais. À l’inverse, les SNPs des gènes KCNJ11 [P=8,0×10−4 ; OR (IC 95 %), 1,27 (1,09–1,47)] et SLC30A8 [P=1,6×10−5 ; OR (IC 95 %), 1,37 (1,15–1,62)] n’étaient associés au DT2 que chez les sujets tunisiens, après ajustement selon le sexe et l’indice de masse corporelle.

Conclusion

Les SNP des loci de susceptibilité au DT2, identifiés par GWAS, sont associés de manière différente dans les deux populations arabes étudiées, ce qui confirme ainsi la contribution de ces variations ethniques dans la susceptibilité au DT2.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Type 2 diabetes, Genetics, Lebanon, Tunisia, Arab population, Genome-wide association studies, SNPs, ENPP1, IGF2BP2, KCNJ11, MLXIPL, PPARγ, SLC30A8, TCF7L2

Mots clés : Diabète de type 2, Génétique, Liban, Tunisie, Populations arabes, Genome-wide association studies, Polymorphismes fréquents, ENPP1, IGF2BP2, KCNJ11, MLXIPL, PPARγ, SLC30A8, TCF7L2


Plan


© 2012  Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
Ajouter à ma bibliothèque Retirer de ma bibliothèque Imprimer
Export

    Export citations

  • Fichier

  • Contenu

Vol 38 - N° 5

P. 444-449 - novembre 2012 Retour au numéro
Article précédent Article précédent
  • Quality of care of patients with type 1 diabetes: Population-based results in a French region
  • A. Penfornis, E. Personeni, M. Tiv, C. Monnier, L. Meillet, J. Combes, C. Mouret, S. Picard
| Article suivant Article suivant
  • Ophdiat®: Five-year experience of a telemedical screening programme for diabetic retinopathy in Paris and the surrounding area
  • C. Schulze-Döbold, A. Erginay, N. Robert, A. Chabouis, P. Massin

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.

Mon compte


Plateformes Elsevier Masson

Déclaration CNIL

EM-CONSULTE.COM est déclaré à la CNIL, déclaration n° 1286925.

En application de la loi nº78-17 du 6 janvier 1978 relative à l'informatique, aux fichiers et aux libertés, vous disposez des droits d'opposition (art.26 de la loi), d'accès (art.34 à 38 de la loi), et de rectification (art.36 de la loi) des données vous concernant. Ainsi, vous pouvez exiger que soient rectifiées, complétées, clarifiées, mises à jour ou effacées les informations vous concernant qui sont inexactes, incomplètes, équivoques, périmées ou dont la collecte ou l'utilisation ou la conservation est interdite.
Les informations personnelles concernant les visiteurs de notre site, y compris leur identité, sont confidentielles.
Le responsable du site s'engage sur l'honneur à respecter les conditions légales de confidentialité applicables en France et à ne pas divulguer ces informations à des tiers.


Tout le contenu de ce site: Copyright © 2024 Elsevier, ses concédants de licence et ses contributeurs. Tout les droits sont réservés, y compris ceux relatifs à l'exploration de textes et de données, a la formation en IA et aux technologies similaires. Pour tout contenu en libre accès, les conditions de licence Creative Commons s'appliquent.