Des outils de détection rapide des bactéries et des virus impliqués dans les infections pulmonaires ont été développés pour pallier les difficultés rencontrées au cours de la pandémie grippale à virus A(H1N1)pdm2009. L’absence de diagnostic avait rendu très difficiles la mise en place de mesures préventives et l’utilisation ciblée des antiviraux. Depuis les techniques de PCR multiplex qui ciblent 15 à 20 pathogènes sur un prélèvement unique se sont établies dans la routine. Les objectifs de ce travail étaient de faire une évaluation précoce de l’impact médical et économique de l’utilisation de la PCR multiplex dans la prise en charge des pneumopathies aiguës communautaires (PAC).

Les patients avec PAC hospitalisés en pneumologie, en réanimation médicale au CHRU de Tours ont été sélectionnés à partir d’un algorithme PMSI sur trois hivers :

– avant l’utilisation de la PCR multiplex (2008–2009);

– en utilisation hebdomadaire (2010–2011);

– en routine quotidienne (2011–2012).

Un retour aux dossiers sur un échantillon aléatoire de 570 patients a permis la validation de l’algorithme PMSI. Un recueil de variables d’intérêt (durée de séjour, durée d’antibiothérapie…) a été mené pour mesurer l’impact de l’utilisation de cette innovation sur la prise en charge et évaluer l’impact économique (estimation des coûts).

Les paramètres de performance du PMSI étaient : sensibilité 94 %, spécificité 85 %, valeur prédictive positive 83 %, valeur prédictive négative 95 % ; 22 % des PAC hospitalisées en 2010–2011 avaient bénéficié d’une PCR, dont 15 % en pneumologie et 31 % en réanimation, et 28 % en 2012–2013, dont 16 % en pneumologie et 56 % en réanimation. En 2010–2011, 58 % des PCR étaient positives et 67 % en 2011–2012. Les analyses de l’impact médico-économiques sont en cours.

Le premier constat est que le recours à la PCR multiplex n’est pas systématique face à une PAC hospitalisée, même en période hivernale.