L'allogreffe de cornée peut entraîner une perte du privilège immunitaire de l'oeil aboutissant au rejet de greffe, première cause d'échec des kératoplasties transfixiantes. Le rejet doit être prévenu par des immunosuppresseurs. Les corticoïdes en collyre agissent de façon non spécifique, et peuvent entraîner une hypertonie, des infections du greffon et défects épithéliaux, une cataracte. Ils restent le traitement de référence de la prévention du rejet d'allogreffe de cornée. En bolus intra-veineux, les corticoïdes sont le seul traitement du rejet aigu. La ciclosporine inhibe spécifiquement la réaction de rejet, en inhibant la transcription de l'interleukine 2 et l'activation spécifique des lymphocytes T. Par voie générale, elle diminue efficacement le taux de rejet chez les patients à haut risque, mais peut avoir de graves effets secondaires (hypertension artérielle, insuffisance rénale et tumeurs malignes). En collyre, elle peut remplacer efficacement les corticoïdes en cas de glaucome cortico-induit et d'infection du greffon, mais peut entraîner des troubles épithéliaux. La ciclosporine n'est pas un traitement du rejet aigu. Le mycophénolate mofétil, le FK 506, sont des molécules prometteuses mais ne peuvent pas encore être utilisés couramment.

Rejection is the leading cause of corneal graft failure, induced by loss of the so-called eye immune privilege. Prevention of graft rejection with immunosuppressive therapy is then necessary. Topical corticosteroids are currently the gold standard, and steroids are the only treatment for acute rejection episodes. Steroids are nonspecific immunosuppressive agents, and they can induce glaucoma, cataract, infections, and epithelial defects. Cyclosporin has a specific effect, because it inhibits interleukin-2 transcription and, consequently, the specific activation of T lymphocytes. When cyclosporin is given orally, it effectively prevents graft rejection in high-risk recipients, but it may induce severe side effects (i.e., systemic hypertension, kidney deficiency, and malignant tumor induction). When cyclosporin is given topically, it can effectively replace steroids in case of dexamethasone-induced glaucoma and graft infection, but it can also induce serious corneal epithelial defects. Cyclosporin is not a treatment for acute rejection episodes. Mycophenolate mofetil and FK 506 are promising drugs, but currently they cannot be used routinely to prevent corneal graft rejection.