La cause génétique sous-jacente des malformations fœtales et autres anomalies structurelles fœtales est souvent insaisissable, conduisant à une incapacité à fournir un diagnostic précis et une évaluation détaillée des risques pesant sur le fœtus ou la future reproduction du couple parental. A cette fin, des nouvelles approches génomiques, basées sur le séquençage massif en parallèle, conduisant au séquençage de l’exome entier (WES), ont été très récemment appliquées^ dans une tentative de donner un aperçu de diagnostic dans ce domaine très sensible. Les avantages et les limites de ces études sont présentés, ainsi que les conclusions basées sur un test concernant le séquençage ciblé de l’exome, couplé à un algorithme de priorisation axé sur la bio-informatique, en mettant l’accent sur les troubles génétiques présentant des résultats de l’échographie prénatale anormaux. Les premiers résultats de cette approche basée sur le séquençage ciblé de l’exome fournissent des preuves solides suggérant une nette augmentation de nos capacités de diagnostic dans le cadre prénatal des fœtus présentant des anomalies échographiques troublantes, bien que chromosomiquement équilibrés. En outre, la stratégie proposée, surmonte un grand nombre des problèmes et limitations associés aux tests WES à grande échelle dans un cadre clinique prénatal.

The underlying genetic cause of fetal malformations and other fetal structural abnormalities is often elusive, leading to an inability to provide a precise diagnosis and accurate reproductive and fetal risk assessment. To this end, new genomic approaches based on massive parallel sequencing and whole exome sequencing (WES) have been very recently applied, in an attempt to provide diagnostic insights in this highly sensitive field. The merits and limitations of these studies are presented, together with the findings of a novel expanded targeted exome sequencing-based test, coupled to a bioinformatics-driven prioritization algorithm, focusing on gene disorders presenting with abnormal prenatal ultrasound findings. The initial findings from this targeted exome sequencing-based approach provide strong evidence suggesting a definite and beneficial increase in our diagnostic capabilities in prenatal diagnosis of chromosomally balanced fetuses with troubling ultrasound abnormalities. Furthermore, the proposed strategy, overcomes many of the problems and limitations associated with clinical wide-scale WES testing in a prenatal setting.