Le reflux gastro-œsophagien est le reflux anormal du contenu gastrique vers l'œsophage. Il s'agit d'une pathologie fréquente. Les manifestations pulmonaires associées au reflux gastro-œsophagien constituent les manifestations atypiques de la maladie. Il s'agit de la toux chronique, de la douleur thoracique (quoique sur le plan physiopathologique le point de départ soit œsophagien, elle est incluse dans cet article car le symptôme est pulmonaire), de l'asthme, de la bronchopneumopathie chronique obstructive, de la pneumopathie infectieuse, de la pneumopathie organisée, de la fibrose pulmonaire idiopathique, de la pneumopathie infiltrante diffuse chez le patient atteint de sclérodermie et de la dilatation des bronches. La toux chronique est dans ce contexte de loin la plus étudiée. Plusieurs données épidémiologiques sont en faveur de la relation de cause à effet entre le reflux et ces manifestations. Cependant, cette causalité n'est pas certaine et ni la pathogénie ni la physiopathologie de ces manifestations ne sont bien élucidées jusqu'à nos jours. Les sociétés savantes ont émis plusieurs recommandations concernant la prise en charge de ces manifestations. Elles reposent pour la plupart sur le traitement empirique par les inhibiteurs de la pompe à protons en première intention. Le rôle de la chirurgie du reflux est encore débattu.