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Application de la technique de PCR en temps réel à l'étude de l'ADN ancien - 01/01/03

Doi : 10.1016/S1631-0683(03)00029-0 

Rym  Kefi a, b ,  Bertrand  Mafart b ,  Jean Louis  Spadoni a, b ,  Alain  Stevanovitch a ,  Éliane  Béraud-Colomb a * *Auteur correspondant.

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Riassunto

L'utilisation de la technique de PCR en temps réel a été testée pour la première fois dans l'étude de l'ADN ancien (ADNa). Les conditions optimales d'amplification déterminées ont permis d'obtenir, en une seule PCR, un produit d'amplification en quantité suffisante pour être directement séquencé. Outre la vérification de l'authenticité de l'ADNa, nous avons comparé deux méthodes de traitement de l'os : le scalpel et l'éthanol. Les spécimens traités à l'éthanol présentaient un meilleur rendement en ADN. Pour la réalisation de ce travail, nous avons analysé la région HVSI de la D-loop mitochondriale de cinq squelettes humains, exhumés du site archéologique de Notre-Dame-du-Bourg. Pour citer cet article : R. Kefi et al., C. R. Palevol 2 (2003) 125-132.

Mots clés  : ADN ancien ; ADN mitochondrial ; HVSI ; PCR en temps réel ; méthodes de traitement de l'os.

Abstract

Real-time Polymerase Chain Reaction (PCR) for the study of ancient DNA. The properties of ancient DNA (aDNA) make difficult the retrieval of DNA sequence. The advantage of Real-Time PCR was exploited, for the first time, in the study of aDNA. We determined the optimal condition to amplify, in one round of PCR, aDNA, which should be directly sequenced. Beside the verification of aDNA authenticity, we compared two cleaning bone methods: scalpel and ethanol. The ethanol specimens showed the best DNA yield. The aDNA was extracted and amplified (mitochondrial hypervariable region I) from five skeletons exhumed from the archaeological site of Notre-Dame-du-Bourg (France), dated from 3rd to 17th century. To cite this article: R. Kefi et al., C. R. Palevol 2 (2003) 125-132.

Mots clés  : ancient DNA ; mitochondrial DNA ; HVSI region ; real-time PCR ; cleaning bone method.

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Vol 2 - N° 2

P. 125-132 - marzo 2003 Ritorno al numero
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