Le hoquet chronique, qui persiste plus de 48 heures (pas forcément continûment), est souvent symptomatique d'une pathologie sérieuse et nécessite une investigation étiologique poussée orientée par la clinique. Ses causes potentielles sont extrêmement nombreuses (en raison des afférences multiples de « l'arc réflexe » du hoquet), dominées par la pathologie œsophagienne et neurologique centrale. Le traitement du hoquet est principalement celui de sa cause. En cas d'impossibilité ou d'efficacité partielle, des traitements physiques, médicamenteux, voire invasifs, peuvent être entrepris empiriquement, la littérature manquant cruellement d'essais thérapeutiques randomisés.