Le déficit en alpha-1 antitrypsine (DAAT) est une maladie génétique autosomique récessive associée à la présence homozygote du variant Z du gène SERPINA1. Quoique rare, environ 10 000 cas en France, le DAAT est le principal endotype de la bronchopneumopathie chronique obstructive (BPCO). L'expression phénotypique est un déficit sévère (< 0,5 g/l pour une valeur normale>1,1 g/l) en alpha-1 antitrypsine (AAT), une BPCO avec un emphysème panlobulaire prédominant aux bases, une hépatopathie cirrhogène et exceptionnellement une panniculite. Les facteurs de risque en sont le tabagisme pour le poumon, l'alcoolisme et l'obésité pour le foie. L'emphysème est évalué par la mesure du coefficient de transfert du monoxyde de carbone (KCO) et par la mesure tomodensitométrique de la densité pulmonaire, la fibrose hépatique par élastographie. Le dosage de l'AAT sérique est la première étape du diagnostic ; en cas de déficit le phénotype est établi par isoélectrofocalisation ou le génotype approché par la détection de variants pathologiques par polymérisation en chaîne (PCR). Les porteurs du variant Z à l'état homozygote ou hétérozygote doivent s'abstenir de fumer et de boire, et contrôler leur poids et informer leur parentèle de l'existence d'un facteur de risque d'emphysème pulmonaire et de cirrhose hépatique. Le variant Z augmente le risque de BPCO, emphysème, cirrhose hépatique, cancer du foie, lithiase biliaire, cholangiocarcinome, maladie thromboembolique veineuse, pneumothorax, bronchectasie, granulomatose avec polyangéite. Il est utile de doser l'AAT chez les personnes présentant l'une de ces maladies afin de les conseiller au sujet du tabac, de l'alcool et du poids et d'organiser une surveillance pneumologique et hépatologique si nécessaire. En cas d'emphysème chez un adulte ZZ dont le volume expiratoire maximal par seconde (VEMS) est entre 35 et 70 % de la valeur théorique, un traitement substitutif par AAT plasmatique humaine est indiqué ; son efficacité a été montrée dans une étude randomisée contre placebo par la diminution du déclin de la densité pulmonaire mesurée sur le scanner.