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Génomique quantitative chez Caenorhabditis elegans : stratégies pour l’identification de nouvelles cibles thérapeutiques et de nouveaux mécanismes moléculaires chez l’homme - 15/09/23

Quantitative genomics in Caenorhabditis elegans: Identification strategies for new human therapeutic targets and molecular mechanisms

Doi : 10.1016/j.rbmret.2008.04.001 
C. Araiz a, c, M.-T. Château a, b, S. Descamps a, c, S. Galas a, , b
a CRBM–CNRS, 1919, route de Mende, 34293 Montpellier cedex 5, France 
b Faculté de pharmacie, université Montpellier-1, 15, avenue Charles-Flahault, BP 14491, 34093 Montpellier cedex 5, France 
c Université Montpellier-2, place Eugène-Bataillon, 34095 Montpellier cedex 5, France 

Auteur correspondant.

Résumé

La publication du génome du nématode Caenorhabditis elegans en 1998 a marqué un tournant dans l’ensemble des programmes de séquençage puisque, pour la première fois, le génome d’un organisme métazoaire était décrypté. Depuis cet inventaire moléculaire, il est rapidement apparu que près de 67 % des gènes associés à des pathologies chez l’homme avait un équivalent chez ce petit ver de 1mm de long. C. elegans peut être maintenu au laboratoire de plusieurs façons (milieux de cultures, alimentation, etc.) qu’il est possible de combiner avec des traitements par des molécules exogènes ou métabolites secondaires tout en tirant avantage du grand nombre de mutants génétiques déjà disponibles ou encore des ciblages moléculaires par ARN interférence ou transgenèse. Grâce à ces caractéristiques, plusieurs stratégies ont d’ores et déjà été développées afin de générer des cribles de médicaments orientés vers de nouvelles cibles ou groupes de cibles thérapeutiques intéressantes pour la santé humaine ou encore pour décrypter certains programmes à l’origine de mécanismes physiologiques régulateurs complexes. Nous proposons ici, par l’utilisation d’exemples, d’illustrer comment de nouvelles cibles thérapeutiques peuvent êtres identifiées grâce à l’utilisation combinée des informations déjà disponibles sur ce modèle qui contribue encore à l’émergence de nouveaux concepts de génomique quantitative.

Il testo completo di questo articolo è disponibile in PDF.

Abstract

Because the entire genome of Caenorhabditis elegans (C. elegans) is available for exploration since 1998, several information have been retrieved about the global interest of this organism when it became apparent that the similarity of genes in this 1mm length nematode and those in humans is remarkable, with approximately 67% of genes that are associated with human disease having homologues in the worm genome. C. elegans worms can be easily maintained on various food-sources and culture media allowing testing for molecules or treatments in combination with different genetic mutants backgrounds as well as RNA interference (RNAi). Because of regulatory pathways conservation between humans and worms, several interesting strategies can be developed to facilitate drugs screenings on specific targets as well as to decipher complex physiological programmed traits with potential identification of new therapeutic targets interesting for human health. By using specific examples, we propose to introduce how to use the already available C. elegans data-cross that can be used as a basis for developing new therapeutic targets identification strategies.

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Mots clés : Caenorhabditis elegans, Génomique quantitative, Génétique, ARNi, Transgène

Keywords : Caenorhabditis elegans, Quantitative genomics, Genetics, RNAi, Transgene


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Vol 29 - N° 5

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