Le développement de formes résistantes de tuberculose est favorisé par la prescription de schémas thérapeutiques mal élaborés ou par la mauvaise observance des patients. L'Organisation mondiale de la santé (OMS) recommande un enregistrement standardisé de tous les cas de tuberculose afin d'évaluer le programme de lutte antituberculeuse. En France, la déclaration de tous les cas de tuberculose maladie, ainsi que de l'issue du traitement est obligatoire. L'incidence mondiale des tuberculoses multirésistantes, c'est-à-dire résistantes à la rifampicine et à l'isoniazide, est évaluée entre 300 000 et 600 000 cas par an. Pour définir le protocole thérapeutique, il est primordial d'obtenir un antibiogramme de bonne qualité testant les antituberculeux de seconde ligne. L'utilisation de tests moléculaires mettant en évidence les mutations responsables des principales résistances permet d'obtenir des indications en quelques jours. Le traitement comprend quatre à six médicaments auxquels la souche est sensible. On utilise en priorité les médicaments de première ligne restants (isoniazide, rifampicine, pyrazinamide, éthambutol), puis une fluoroquinolone et un aminoside ou apparenté. Enfin, on complète avec les antituberculeux de deuxième ligne (éthionamide, cyclosérine, acide para-amino-salicylique [PAS]). En dernier recours, on fait appel à des médicaments dont l'efficacité n'est pas clairement démontrée in vivo. Il est important de ne jamais ajouter une seule molécule à un protocole inefficace afin de ne pas sélectionner de résistance en cascade. La durée du traitement varie de 18 à 24 mois et la gestion des effets secondaires est particulièrement importante, compte tenu de la tolérance très médiocre des antituberculeux de deuxième ligne.