Une élévation chronique des transaminases ou hypertransaminasémie chronique est définie par une augmentation des transaminases supérieure à 1,5 fois la limite supérieure de la normale, documentée à deux reprises pendant plus de 6 mois. L'interrogatoire à la recherche d'une consommation à risque d'alcool ou de médicaments hépatotoxiques, des données démographiques simples comme l'âge, la taille, le poids, le périmètre abdominal, l'indice de masse corporelle, des examens biologiques et virologiques simples : glycémie à jeun, bilan lipidique, recherche de l'antigène HBs, sérologie de l'hépatite C, bilan martial et une échographie abdominale permettent de faire le diagnostic de plus de 95 % des causes d'hypertransaminasémie chronique. La stéatopathie métabolique, expression hépatique du syndrome métabolique, est la cause la plus fréquente d'hypertransaminasémie chronique ; la maladie alcoolique du foie, les hépatites chroniques virales et l'hémochromatose génétique sont également des causes fréquentes ; parmi les causes non hépatiques d'hypertransaminasémie chronique, la maladie coeliaque doit faire partie du bilan dès que ces quatre grandes causes ont été éliminées ; elle est beaucoup plus souvent en cause que les maladies hépatiques rares (maladie de Wilson, etc.). La ponction-biopsie hépatique, indiquée lorsqu'« on n'a rien trouvé », permet le diagnostic de maladies plus rares du foie.