La coqueluche est une infection respiratoire bactérienne strictement humaine, gravissime pour les nouveau-nés et parfois pour les personnes âgées. Les agents de la maladie sont les bactéries Bordetella pertussis et parapertussis. Ces bactéries extracellulaires, qui sécrètent toxines et adhésines, sont responsables des effets cytopathogènes locaux et systémiques observés lors de la maladie tels la destruction de l'épithélium respiratoire cilié et l'hyperlymphocytose. La vaccination intensive des enfants avec des bactéries tuées a permis la diminution de la mortalité et de la morbidité dans la plupart des pays développés. Cependant, la généralisation de la vaccination a aussi mis en évidence que l'immunité naturelle tout comme l'immunité vaccinale est de durée limitée. On observe à l'heure actuelle dans les populations vaccinées un changement de transmission de la maladie, les adultes contaminant les nourrissons non vaccinés pour qui la maladie peut être mortelle. En raison de ce danger pour les nourrissons, plusieurs pays, dont la France, ont ajouté des rappels vaccinaux pour l'adolescent et l'adulte. La surveillance passe par l'utilisation de diagnostics biologiques spécifiques car la clinique peut être atypique chez les adolescents et adultes anciennement vaccinés.