Les parasites ont rarement une localisation strictement rénale. Cependant, la bilharziose urinaire est très fréquente en Afrique subsaharienne et se manifeste par une hématurie. L'hydatidose est essentiellement localisée au niveau hépatique, mais des localisations rénales sont possibles. D'autres parasitoses (filarioses, paludisme) provoquent des glomérulonéphrites par des réactions immunologiques, qui disparaissent avec le traitement spécifique du parasite responsable.