La prescription d'un médicament à visée comportementale est complexe et doit suivre certaines règles, en particulier ne pas empêcher la mise en place des techniques de modifications comportementales. Les psychotropes représentent une technique biologique de traitement des troubles du comportement et doivent être considérés comme des adjuvants parfois utiles pour permettre la réalisation d'un programme de changement comportemental. Certains psychotropes comme les neuroleptiques, les benzodiazépines, certains anxiolytiques sédatifs, empêchent la mise en place des techniques de modifications comportementales, en particulier des apprentissages, en raison de leurs effets sédatifs ou amnésiants. D'une façon générale, les associations médicamenteuses sont vivement déconseillées entre psychotropes mais aussi avec des molécules non psychotropes. Les fonctions des principaux neuromédiateurs sont envisagées avant de décrire les modes d'action et les indications des psychotropes existant en médecine vétérinaire : la clomipramine, la fluoxétine et la sélégiline. Quelques autres molécules non psychotropes sont envisagées : les apaisines, l'alpha-casozépine, et la L-théanine.