Le lapin de compagnie se vaccine contre la myxomatose et la maladie hémorragique virale. Ces deux maladies sont encore courantes, et leurs taux de morbidité et de mortalité sont très élevés. Seule la vaccination permet une protection efficace. L'apparition d'un nouveau vaccin recombinant permet un protocole simple et efficace. Les traitements antiparasitaires sont insuffisamment développés chez cette espèce, malgré des mesures relativement simples à mettre en place. L'imidaclopride est notamment recommandé pour la prévention des puces. Les lactones macrocycliques (selamectine, moxidectine) apportent en plus un spectre antiparasitaire ciblé (nématodicide). Les formulations spot-on sont adaptées et à privilégier chez le lapin de compagnie afin de garantir notamment une bonne observance de la part des propriétaires.