Molecular dating has now become a common tool for many biologists and considerable methodological improvements have been made over the last few years. However, the practice of estimating divergence times using molecular data is highly variable among researchers and it is not straightforward for a newcomer to the field to know how to start. Here I provide a brief overview of the current state-of-the-art of molecular dating practice. I review some of the important choices that must be made when conducting a divergence time analysis, including how to select and use calibrations and which relaxed clock model and program to use, with a focus on some practical aspects. I then provide some guidelines for the interpretation of results and briefly review some alternatives to molecular dating for obtaining divergence times. Last, I present some promising developments for the future of the field, related to the improvement of the calibration process.

La datation moléculaire est devenue un outil commun pour de nombreux biologistes et des progrès méthodologiques considérables ont été apportés ces dernières années. Cependant, l’estimation des temps de divergence à partir de données moléculaires demeure très variable dans sa pratique et sa mise en œuvre est délicate pour le novice. Cet article propose une revue concise de l’état de l’art de la pratique de la datation moléculaire. Plusieurs décisions importantes sont nécessaires, notamment la sélection et l’implémentation des calibrations, ainsi que le choix d’un modèle d’horloge relâchée et le logiciel pour l’analyse. Après une discussion de certains aspects pratiques de la conduite de ces analyses, plusieurs règles sont proposées pour l’interprétation des résultats. Les alternatives possibles pour obtenir des temps de divergence sont également discutées. Enfin, plusieurs développements prometteurs pour l’avenir de la discipline sont soulignés, en particulier dans le cadre de l’amélioration du processus de calibration.