Les troubles du spectre autistique (TSA) se définissent par l'association de troubles de la communication sociale et des comportements restreints et stéréotypés. Sous cette définition sont rassemblés des troubles d'une extrême hétérogénéité. Cette hétérogénéité clinique a pendant longtemps constitué un frein à la compréhension des mécanismes physiopathologiques en cause dans les TSA, et les preuves de l'existence d'une prédisposition génétique aux TSA ont précédé de loin les premières avancées significatives de la recherche de facteurs génétiques prédisposants. Néanmoins, les dernières années ont été marquées par des avancées importantes concernant la compréhension des facteurs génétiques impliqués dans le déterminisme de ces troubles. En effet, après une décennie marquée par une mobilisation importante pour constituer des cohortes de grande taille visant à identifier des variations génétiques prédisposant au trouble par des études de liaison et d'association, le retour à une approche individuelle, par la recherche directe de mutations rares ou de remaniements chromosomiques, a permis de formuler les premières hypothèses concernant les mécanismes physiopathologiques sous-tendant le développement des TSA. Ces études ont permis de montrer qu'il existe une très grande hétérogénéité des facteurs génétiques prédisposant aux TSA, associant des mutations rares et des variations fréquentes. Néanmoins, il semble exister une certaine convergence vers un nombre limité de processus cellulaires entravés. L'objectif de cet article est de présenter la synthèse des principales études ayant permis ces avancées et dans un second temps, de résumer brièvement les recommandations en termes d'investigations paracliniques à réaliser chez les patients en situation clinique.