La fosfatasa alcalina (FA, o ALP por sus siglas en inglés) es una metaloenzima de membrana ubicua que hidroliza los fosfomonoésteres a un pH alcalino óptimo. En el ser humano existen cuatro isoenzimas principales: FA no específica de tejido (TNSALP, o FA de hígado/hueso/riñón), FA intestinal (IALP), FA placentaria (PALP) y FA germinal (o similar a la placentaria); las dos primeras son igualmente prevalentes en el suero (90% entre ambas). La actividad de la FA, que debe medirse en ayunas, aumenta de manera fisiológica durante el crecimiento óseo y el embarazo. Un aumento de la FA asociado al de la gamma-glutamiltransferasa (GGT) es de origen hepático. Se observa en la colestasis, ya sea extrahepática o intrahepática (y en este último caso de origen colangiocelular o hepatocítico), y puede observarse (con intensidad más modesta) en casi todas las hepatopatías. Existen muy pocos casos de colestasis genética con GGT normal. Un aumento aislado (o muy predominante) de la FA suele ser de origen óseo e indica una elevada actividad osteoblástica; las principales causas son la enfermedad de Paget ósea, la osteomalacia y el raquitismo, las metástasis óseas y los sarcomas osteogénicos. La FA puede observarse en síndromes paraneoplásicos. El aumento de la actividad de la FA tiene un valor pronóstico en las enfermedades colestásicas crónicas y en la insuficiencia renal. La disminución de la FA puede deberse a la deficiencia de zinc, la deficiencia de vitamina B₁₂ y el hipotiroidismo. Es el signo principal de la hipofosfatasia, un error congénito del metabolismo causado por una pérdida de función del gen que codifica la TNSALP. La expresión fenotípica es variable, más precoz y más abundante cuanto más grave es la carencia: pérdida prematura de los dientes de leche, raquitismo u osteomalacia resistente a la vitamina D, hipercalcemia, convulsiones. Ya existe un tratamiento específico. Por último, se está investigando el uso terapéutico de la FA (derivada de la isoenzima intestinal).