La protéine S (PS) est un inhibiteur physiologique de la coagulation. C'est un catalyseur non enzymatique de la protéine C activée (PCa) impliquée dans l'inhibition des cofacteurs Va et VIIIa. La PS exerce également une activité anticoagulante indépendante de la PCa. Son déficit représente un facteur de risque d'évènement thromboembolique principalement veineux. Ce risque est moins important que celui associé au déficit en antithrombine. Le diagnostic du déficit constitutionnel en PS repose en premier lieu sur des tests phénotypiques. L'activité anticoagulante, cofacteur de la PCa, est proposée en première intention étant donné sa sensibilité aux différents types de déficits congénitaux aussi bien quantitatifs que qualitatifs. La mesure antigénique de la forme libre, non liée à la chaîne bêta de la C4b-binding protein (C4bBP), ainsi que de la PS totale permet de caractériser tout déficit congénital confirmé. Les résultats des différentes mesures de la PS peuvent être discordants en fonction des réactifs utilisés ou même dans les limites de la normale chez des patients pourtant porteurs d'une anomalie du gène PROS1 codant la PS. L'analyse moléculaire de PROS1 permet alors de porter un diagnostic de certitude et ainsi faciliter les décisions de prise en charge du patient. Nous nous proposons dans cet article de passer en revue les caractéristiques de la PS, du gène à la protéine, ses différentes méthodes d'étude phénotypique et génotypique, ainsi que les différents types de déficits congénitaux et acquis. Nous proposons également une stratégie diagnostique de tout éventuel déficit en PS.