Les infections humaines à Chlamydiae, eubactéries à développement intracellulaire obligatoire, posent des problèmes de santé publique par leur fréquence et leurs complications. Chlamydia trachomatis est en France le principal agent bactérien responsable d'infections sexuellement transmissibles (IST). Le caractère paucisymptomatique de l'infection urogénitale est à l'origine de la dissémination et des complications observées chez la femme jeune telles que les salpingites et les grossesses extra-utérines. L'utilisation des tests de biologie moléculaire autorise le dépistage de l'infection sur des prélèvements non invasifs tels que l'autoprélèvement vaginal et l'urine chez l'homme, permettant un traitement précoce et évitant le développement de complications. Le traitement des IST non compliquées à C. trachomatis repose sur l'azithromycine ou la doxycycline, le dépistage et traitement des partenaires, associé aux mesures de prévention recommandées. L'épidémie actuelle de lymphogranulomatose vénérienne (LGV) rectale impose une surveillance microbiologique et clinique des patients présentant une rectite. Seul le typage des échantillons positifs à C. trachomatis permet le diagnostic de LGV. Chlamydia pneumoniae est responsable de pneumopathies communautaires bénignes. La séroprévalence augmente avec l'âge et le diagnostic repose essentiellement sur des techniques d'amplification des acides nucléiques. Son rôle dans l'asthme et la maladie athéromateuse est controversé. Chlamydia psittaci, espèce d'origine animale, contamine l'homme occasionnellement par contact avec des oiseaux malades ou porteurs sains dans les élevages, à l'abattage ou encore au domicile. La psittacose est responsable chez l'homme d'une infection respiratoire pouvant être sévère. Elle peut être déclarée en maladie professionnelle. Le diagnostic repose sur un faisceau d'arguments cliniques, épidémiologiques et biologiques et le traitement repose sur la doxycycline.