La cryptosporidiose est une parasitose émergente due à des protozoaires intracellulaires qui décrivent leur cycle dans la bordure en brosse des entérocytes, et sont responsables de diarrhée ou de gastroentérite. Si elle est spontanément résolutive chez les sujets bien portants, cette infection est souvent sévère et prolongée chez les patients immunodéprimés, induisant une diarrhée à la fois sécrétoire et de malabsorption à l'origine d'une dénutrition majeure. La maladie est cosmopolite. Elle est le plus souvent due à Cryptosporidium hominis, parasite spécifique de l'homme, et à C. parvum, parasite des mammifères d'élevage. Mais d'autres espèces parasites d'oiseaux (C. meleagridis), du chat (C. felis), ou de divers animaux (chien, porc) peuvent être impliquées. De nombreuses épidémies de cryptosporidiose à transmission hydrique ont été décrites dans les années 1990-2000 y compris en France. Le diagnostic de laboratoire nécessite des techniques d'identification spécifiques et suppose donc un dialogue entre clinicien et biologiste. Chez les patients infectés par le VIH, la reconstitution immunitaire par une multithérapie antivirale est l'approche la plus efficace pour prévenir ou contrôler la cryptosporidiose. Le traitement anti-infectieux de première intention repose actuellement sur le nitazoxanide. Mais la sévérité de la maladie chez les patients immunodéprimés, et le risque épidémique d'origine hydrique soulignent l'importance de mesures individuelles et collectives de prévention.