Les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin (MICI) sont des affections d'évolution chronique qui résultent de l'inflammation d'une partie de la paroi intestinale. Elles sont suspectées chez tout patient se présentant avec une symptomatologie digestive à type de douleurs abdominales, diarrhées, altération de l'état général, etc. Actuellement, leur diagnostic repose essentiellement sur des arguments cliniques et endoscopiques. L'utilisation d'un test d'orientation facile à utiliser, rapide, fiable, non invasif et peu coûteux doit non seulement aider au diagnostic mais aussi contribuer à leur suivi évolutif et thérapeutique. À ce jour, la calprotectine fécale paraît la plus documentée dans cette perspective. La calprotectine est une protéine de liaison au calcium et au zinc présente dans le cytosol des polynucléaires neutrophiles (PNN) et des macrophages. Ce marqueur permet de discriminer entre les processus fonctionnels et organiques intestinaux avec une bonne sensibilité et une bonne spécificité. Cependant, la calprotectine mesurant l'infiltration inflammatoire de la muqueuse, des concentrations fécales élevées sont retrouvées non seulement au cours des MICI mais aussi dans d'autres pathologies à composante inflammatoire tels les entérites infectieuses ou les cancers colorectaux. Une calprotectine fécale augmentée constitue donc une indication pour la réalisation d'une endoscopie digestive. Enfin, la concentration fécale de la calprotectine étant corrélée au degré d'inflammation de la muqueuse tel que mesuré par les scores endoscopiques, son dosage contribue à l'évaluation du degré d'activité de la maladie et au suivi de la réponse thérapeutique.